Images numériques en biologie

Images numériques en biologie

Images numériques en biologie

(Gil Voge, 11 et 13 Février 2008, Lycée Philibert Delorme, L'Isle d'Abeau)

Programme de la journée :

  • Les images numériques
    • principales caractéristiques d'une image numérique (définition, dynamique, résolution)
    • modes colorimétriques (RVB, CMJ+N)
  • Initiation au logiciel The Gimp
    • retouche d'images (orientation, cadrage, luminosité et contraste, retouche de détails)
    • composition d'une image à partir de fichiers de caractéristiques différentes (manipulation des calques)
  • Initiation au logiciel ImageJ
    • manipulations (simples) de fichiers DICOM (imagerie médicale)
    • analyse quantitative d'un gel d'électrophorèse
    • analyse de particules (colonies bactériennes sur une gélose)
    • localisation intracellulaire de marqueurs fluorescents
    • mesure de la fluidité membranaire (Fluorescence Recovery After Photobleaching)
    • installation et utilisation d'un plugin (Cell Counter, application en hématologie)
    • réalisation et utilisation d'une macro (automatisation de la lecture d'une microplaque et dénombrement des colonies bactériennes sur une série de géloses)
Présentation et documents annexes
Fichier attachéTaille
PDF icon Document d'accompagnement2.94 Mo
PDF icon Mémo-web50.54 Ko
Fichiers utilisés avec Gimp

Le fichier angiographie.dcm.pdf a été grimmé en fichier pdf pour pouvoir être proposé au téléchargement. Pour l'utiliser  avec ImageJ il convient d'abord de lui retirer l'extension .pdf tout en conservant l'extension .dcm.