Stage de formation « Images numériques en biologie »
(Gil Voge, 11 et 13 Février 2008, Lycée Philibert Delorme, L'Isle d'Abeau)
Programme de la journée
- Images numériques
- principales caractéristiques d'une image numérique (définition, dynamique, résolution)
- modes colorimétriques (RVB, CMJ+N)
- Initiation au logiciel Gimp
- retouche d'images (orientation, cadrage, luminosité et contraste, retouche de détails)
- composition d'une image à partir de fichiers de caractéristiques différentes (manipulation des calques)
- Initiation au logiciel ImageJ
- manipulations (simples) de fichiers DICOM (imagerie médicale)
- analyse quantitative d'un gel d'électrophorèse
- analyse de particules (colonies bactériennes sur une gélose)
- localisation intracellulaire de marqueurs fluorescents
- mesure de la fluidité membranaire (Fluorescence Recovery After Photobleaching)
- installation et utilisation d'un plugin (Cell Counter, application en hématologie)
- réalisation et utilisation d'une macro (automatisation de la lecture d'une microplaque et dénombrement des colonies bactériennes sur une série de géloses)
Fichiers à télécharger
Présentation et documents annexes
Fichiers utilisés avec Gimp
Fichiers utilisés avec ImageJ
Fichier .zip à décompresser sous la forme d’un fichier d’extension .dcm pour l’utiliser avec ImageJ