Stage de formation « Images numériques en biologie »

(Gil Voge, 11 et 13 Février 2008, Lycée Philibert Delorme, L'Isle d'Abeau)

Programme de la journée

  • Images numériques
    • principales caractéristiques d'une image numérique (définition, dynamique, résolution)
    • modes colorimétriques (RVB, CMJ+N)
  • Initiation au logiciel Gimp
    • retouche d'images (orientation, cadrage, luminosité et contraste, retouche de détails)
    • composition d'une image à partir de fichiers de caractéristiques différentes (manipulation des calques)
  • Initiation au logiciel ImageJ
    • manipulations (simples) de fichiers DICOM (imagerie médicale)
    • analyse quantitative d'un gel d'électrophorèse
    • analyse de particules (colonies bactériennes sur une gélose)
    • localisation intracellulaire de marqueurs fluorescents
    • mesure de la fluidité membranaire (Fluorescence Recovery After Photobleaching)
    • installation et utilisation d'un plugin (Cell Counter, application en hématologie)
    • réalisation et utilisation d'une macro (automatisation de la lecture d'une microplaque et dénombrement des colonies bactériennes sur une série de géloses)

Fichiers à télécharger

Présentation et documents annexes

Fichiers utilisés avec Gimp

Fichiers utilisés avec ImageJ

Fichier .zip à décompresser sous la forme d’un fichier d’extension .dcm pour l’utiliser avec ImageJ